Os primeiros restos arqueológicos da Rota e da sua história se remonta aos tempos pré-históricos. As ruínas dos Fenícios e os vestígios de várias civilizações têm sido encontrados até hoje em seus domínios.

Astaroth, Asta Regia, Rabbita Ruta, Oraculum menester, Oleastrum, Speculum Rotae, Rotta e finalmente Rota, foram alguns dos nomes que foram adoptados por esta cidade de Cádis, desde o início até os dias actuais.

Por Rota também passaram os fenícios, os romanos, os árabes, os cristãos ... todas as civilizações têm chegado e deixaram parte de seu legado nesta terra. Sancho IV, nos finais dos século XIII ordenou a construção de Atalayas para a defesa desta cidade, mais tarde, Alonso Pérez de Guzmán se assumiu com o domínio de todas essas terras depois de que Fernando IV cederia a cidade, passaram por aqui os Reis Católicos, Isabel e Fernando nos finais do século XV ...
Durante os séculos seguintes, Rota escreveu páginas importantes da história da Espanha, foi o local onde desembarcaram os anglo-Holandeses na Guerra da Sucessão Espanhola após a morte de Carlos II, foi vítima de peste, cólera e outras epidemias que deixaram a cidade muito esgotada, a Desmortização de Mendizabal é favorável à que se abandone o Convento de Mercedária ...

Em 1955 se estabeleceu em Rota a base militar, o que levou a uma mudança na economia da cidade, que até então vivia da agricultura e da pesca, hoje em dia, a pesca e o turismo são especialmente a base da economia de Rota. Rota é uma cidade preparada para receber um grande número de turistas, tem infra-estruturas, comunicações e centenas de bares e restaurantes.